能仁寺，原来玉虹洞址。玉虹洞以岩壑幽邃，泉石离奇，龙腾象跃，云烟飘缈而为白云山之名洞。南宋李昂英曾在此筑玉虹饮涧亭及小隐轩，结诗社。

    据番禺志，能仁始建于道光年四年。然据咸丰三年《重修能仁寺记碑》，其时仅“茆屋数椽，仅避风雨”而已。寺僧了尘，俗称刘四和尚，本顺天贵胄，父兄皆官居总兵，本人亦考中武举。后忽悟“大丈夫不当壮游万里乎！”遂游侠四方，至此地，喜玉虹洞之岩壑幽深，拜吟坚上人为师，并发大原“欲作大观”。经数十年，积殊累寸，终成宏愿，于咸丰元年开工三年落成。光绪十三年，寺僧惟中又大加扩建，扩建后能仁寺的规模为：牌坊（上书“佛境”）、山门（有苏曼 殊所书“金刚法界”额）、大雄宝殿、慈云殿（殿下有“甘露泉”）、地藏殿、三摩地（静室）、无尘地（静室）六祖殿、宝月阁（知客）、钟楼、鼓楼、祖师堂、说法堂、库房、香积橱、斋堂、客堂，尚保留玉虹池旧迹，当时主持僧维中刻石碣于上，寺前水溪即弥勒坑水。寺门后有石桥，题有“流云漂月”四字，传为昔日之虹桥旧迹云，桥下流水湍急，直泻而下，今已渐涸。佛殿侧之虎跑泉仍在，观音殿后现保留甘露井，亦名泉也。民国后由虚云僧主持，香火甚盛，后亦毁于兵灾。

    弘扬历史文化，发展我市旅游事业，广州市政府于1993年投资1500万参照旧制重建，恢复的景点有钟鼓楼、大雄宝殿、慈云殿等，于1995年5月对外开放。能仁寺占地面积为10000万平方米，地势三面环山，幽谷深藏，绿树成萌，内有大雄宝殿、慈云殿等庙宇，有佛像34尊，对联11幅，含意深奥，意趣横生。寺里主要古迹有虎跑泉、甘露泉、玉虹池、流云飘月、古桥等，还有抗法英雄黑旗将军刘永福一笔写下的一个高2米宽1米的红色“虎”字，为这个庄严静穆的山寺增添了几分浩气。1924年5月19日孙中山先生揩同夫人曾到此游览，1966年，日本青年代表团曾来这里栽下了一片樟树 ----“中日青年友谊林”。

    能仁寺是白云山恢复文物古迹中的典范，它以气势宏大，古迹众多，灵验的风水宝地而吸引了许多前来参观与朝拜的游客。但能仁寺有一条与别的景区寺庙不同之处是：寺内没有香火，这是为了更好地净化白云山“市肺”的空气，同时也为了杜绝山火隐患。